2010年12月29日 星期三

Protein-Protein Interaction

利用網路上提供的STRING 8.3來看欲探討某protein與其他protein之間的交互作用
http://string.embl.de/newstring_cgi/show_input_page.pl?UserId=OtTDdNLsOyOX&sessionId=XmR18k3OQNwf
輸入p53 Organism選擇 Homo sapiens,接著按下GO
當然也可以輸入protein sequence

再選擇想要看與哪個protein有交互作用,按下continue
confidence view

還可以選擇下列的不同功能來看

Evidence view

我們可以選取一個與TP53有交互作用的蛋白質來看他的結構,舉MDM2為例:

還可以選擇下列的不同參數來看
得到如圖示:  
再看別的不同參數

因而產生不同的交互作用圖示:

還可用不同的view來看

選擇Occurence view來看


還可以選擇Experiment來試試

另外一個網站BOND
輸入p53按下GO
再選擇interactions
接著選擇不同的View
會出現不同的結果

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